Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rabep1O35551 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rabep1O35551 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rabep1O35551 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 922.4 ms