Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CrcpO35427 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CrcpO35427 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CrcpO35427 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CrcpO35427 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CrcpO35427 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CrcpO35427 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms