Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfrsf11aO35305 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf11aO35305 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf11aO35305 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms