Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ArxO35085 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ArxO35085 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ArxO35085 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ArxO35085 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ArxO35085 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ArxO35085 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ArxO35085 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ArxO35085 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ArxO35085 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ArxO35085 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ArxO35085 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ArxO35085 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ArxO35085 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ArxO35085 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArxO35085 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArxO35085 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArxO35085 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArxO35085 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ArxO35085 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ArxO35085 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArxO35085 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArxO35085 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArxO35085 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArxO35085 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ArxO35085 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ArxO35085 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms