Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec22bO08547 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec22bO08547 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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