Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1oL7MU04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2al1oL7MU04 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2al1oL7MU04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms