Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2056J3QQ02 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2056J3QQ02 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm2056J3QQ02 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms