Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2035J3QP87 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm2035J3QP87 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms