Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms