Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7137J3QMW1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm7137J3QMW1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms