Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sclt1G5E861 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sclt1G5E861 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sclt1G5E861 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms