Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp32F8VPZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp32F8VPZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp32F8VPZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp32F8VPZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp32F8VPZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp32F8VPZ3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms