Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M1F7CXU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M1F7CXU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M1F7CXU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms