Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh11xF6ZNL5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh11xF6ZNL5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh11xF6ZNL5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms