Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm10563F6WIE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm10563F6WIE4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm10563F6WIE4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm10563F6WIE4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms