Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21974F6W3F3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21974F6W3F3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms