Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc1E9Q5K9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ythdc1E9Q5K9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms