Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DspE9Q557 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DspE9Q557 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DspE9Q557 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DspE9Q557 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DspE9Q557 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DspE9Q557 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms