Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930579F01RikE9Q3L6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930579F01RikE9Q3L6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930579F01RikE9Q3L6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms