Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3020E9Q3J7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3020E9Q3J7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3020E9Q3J7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms