Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Wdr17E9Q271 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Wdr17E9Q271 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Wdr17E9Q271 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Wdr17E9Q271 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Wdr17E9Q271 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Wdr17E9Q271 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdr17E9Q271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Wdr17E9Q271 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms