Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt90E9Q1Z0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt90E9Q1Z0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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