Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrp3E9Q1T6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrp3E9Q1T6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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