Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms