Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm9972E9Q053 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms