Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Fndc1E9Q043 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Fndc1E9Q043 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fndc1E9Q043 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Fndc1E9Q043 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms