Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph10bE9PYQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsph10bE9PYQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms