Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim30dE9PWL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trim30dE9PWL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim30dE9PWL0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms