Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm2956E9PVJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm2956E9PVJ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm2956E9PVJ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms