Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1110002E22RikE0CYV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1110002E22RikE0CYV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1110002E22RikE0CYV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1110002E22RikE0CYV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms