Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lonrf1D3YY23 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lonrf1D3YY23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms