Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc170D3YXL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms