Protein–RNA interactions for Protein: D3YWB7

Gm4297, Predicted gene 4297, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4297D3YWB7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4297D3YWB7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4297D3YWB7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4297D3YWB7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms