Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrc5C3VPR6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrc5C3VPR6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrc5C3VPR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc5C3VPR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc5C3VPR6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc5C3VPR6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrc5C3VPR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms