Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11cB4XVP9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Phf11cB4XVP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Phf11cB4XVP9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms