Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Abcc8B2RUS7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.43
Abcc8B2RUS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Abcc8B2RUS7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Abcc8B2RUS7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Abcc8B2RUS7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Abcc8B2RUS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms