Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrt4B2RU40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrt4B2RU40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms