Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1bp1B2KF50 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1bp1B2KF50 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms