Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scml2B1AVB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms