Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprsB0V2N1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprsB0V2N1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprsB0V2N1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms