Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttll11A4Q9F4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll11A4Q9F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms