Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GabreA2AMW3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GabreA2AMW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms