Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SetxA2AKX3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetxA2AKX3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms