Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam71e1A1L3C1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Fam71e1A1L3C1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam71e1A1L3C1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam71e1A1L3C1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam71e1A1L3C1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam71e1A1L3C1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam71e1A1L3C1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam71e1A1L3C1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms