Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4921501E09RikA0A0R4J054 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4921501E09RikA0A0R4J054 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms