Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trbv21A0A0A6YX06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Trbv21A0A0A6YX06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Trbv21A0A0A6YX06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Trbv21A0A0A6YX06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Trbv21A0A0A6YX06 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Trbv21A0A0A6YX06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trbv21A0A0A6YX06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Trbv21A0A0A6YX06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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