Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nek3Q9R0A5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nek3Q9R0A5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nek3Q9R0A5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nek3Q9R0A5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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