Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms