Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChmQ9QXG2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChmQ9QXG2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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