Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mid2Q9QUS6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms